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發(fā)布于 2022年2月16日

近日，《自然》雜志推出2022值得年度關(guān)注的榜單技術(shù)，其中空間多組學(xué)技術(shù)就榜上有名，該技術(shù)不僅在2020年被Nature Methods評為年度技術(shù)方法，同樣在2021年大量科學(xué)先后報(bào)道了空間多組學(xué)技術(shù)在不同領(lǐng)域重大突破和發(fā)現(xiàn)，再次在2022年被評為值得關(guān)注的7大年度技術(shù)之一。我們不僅感嘆空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的強(qiáng)大，這里就不得不回顧一下在過去的一年中空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的應(yīng)用和發(fā)展。

2022年值得關(guān)注的7大技術(shù)榜單

2021年利用空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)發(fā)文章呈現(xiàn)井噴式增長，其中已正式發(fā)表文章有40余篇，而空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)為特色的預(yù)印本bioRxiv搜索“空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)（spatial transcriptomics）”一詞，獲得了500余條結(jié)果，其中80余條是在2021年提交的，可以說2021年是空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)應(yīng)用好文發(fā)表突飛猛進(jìn)的一年。

2016年-2021年空間轉(zhuǎn)錄組文章發(fā)表趨勢和影響因子分布

通過檢索空間轉(zhuǎn)錄組發(fā)表文章的數(shù)據(jù)分析來看，該技術(shù)在2021年中得到廣泛應(yīng)用，并且文章影響因子主要集中在10~20分區(qū)間，其占比高達(dá)39%，其次在30分以上占比達(dá)到30%，由此可見空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的應(yīng)用極大提升了文章的質(zhì)量和檔次。

不僅如此，2021年空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)還在物種上有了新的突破，不再局限于人和鼠常見的模式物種，已經(jīng)開始邁入哺乳動物（豬）、家禽類（雞）、植物類（擬南芥、云杉、楊樹）等新的物種領(lǐng)域，極大拓展其應(yīng)用范圍。

物種空間轉(zhuǎn)錄組文獻(xiàn)發(fā)表統(tǒng)計(jì)

2021年空間轉(zhuǎn)錄組在不同組織部位上應(yīng)用也取得一些新進(jìn)展：比如骨組織一類就有不少文章發(fā)表，有頭蓋骨[PNAS，IF=11.2]、腰骨骼肌[NatureCommunications，IF=14.9]、肩部肌腱[AnnRheum Dis，IF=19.1 ]；生殖器官有子宮內(nèi)膜[Nat Genet，IF=27.6]、卵巢[NatureBiotechnology，IF=54.9]；泌尿系統(tǒng)：前列腺[Nature Communications，IF=14.9]、膀胱[NatureCommunications，IF=14.9]；腸道組織：胎兒腸道[Cell，IF=41.6]；脂肪組織：皮下腹部[CellMetabolism，IF=27.3]；腦組織：腦內(nèi)炎癥[[Ann Rheum Dis，IF=19.1 ]，IF=24.9]、等皮質(zhì)和海馬[Cell，IF=41.6]、腦神經(jīng)系統(tǒng)[AnnuRev Neurosci，IF=12.4]、前額葉皮層[Nat Neurosci，IF=24.9]、海馬和前額葉皮質(zhì)[NatureCommunications，IF=14.9]等都組織區(qū)域都有不錯(cuò)的研究報(bào)道，甚至連取材最困難的皮膚樣本都發(fā)表重要研究成果：皮膚肉芽腫[Nature Immunology ，IF=25.6]，空間轉(zhuǎn)錄組逐漸在更多的組織類型上得到廣泛的應(yīng)用，揭示更深層次空間維度生物學(xué)表型。

空間轉(zhuǎn)錄組不同組織應(yīng)用發(fā)表文獻(xiàn)統(tǒng)計(jì)

基于上面數(shù)據(jù)我們不難看出來前期研究，腦組織空間基因表達(dá)探索最為廣泛，當(dāng)然還有心臟組織、肝組織前列腺組織；植物主要集中在花序器官的研究，隨著各種組織探索和嘗試，基本上空間轉(zhuǎn)錄組已經(jīng)在各種組織中全面開火，不管從技術(shù)的前瞻性也好，還是從空間這個(gè)維度深度闡釋一些生物學(xué)現(xiàn)象，彌補(bǔ)了細(xì)胞空間位置信息的趨勢，空間多組學(xué)技術(shù)毫無疑問成為引領(lǐng)科學(xué)研究的風(fēng)向標(biāo)。