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 分類: 時空組學(xué)

白駒過隙,時光荏苒。2022年百邁客突破國外技術(shù)壟斷,推出百創(chuàng)系列產(chǎn)品,提供植物單細胞測序新方案,打造單細胞&空間個性化交互式分析,成功助力蝴蝶蘭花器官時空圖譜國內(nèi)首秀,積累了豐富的項目經(jīng)驗。接下來,讓我們一起來看看今年百邁客在單細胞&空間組學(xué)上有哪些突破。

百創(chuàng)智造,破界而出

百創(chuàng)DG1000突破直徑壁壘:為了突破單細胞試劑耗材及儀器長期以來的國外技術(shù)壟斷,降低單細胞應(yīng)用的成本,突破主流平臺40μm細胞直徑限制,滿足更多的單細胞場景需求。經(jīng)過潛心研發(fā),百邁客發(fā)布了自主研發(fā)的單細胞微液滴系統(tǒng)-百創(chuàng)DG1000。

百創(chuàng)DG1000單細胞微液滴系統(tǒng)

百創(chuàng)DG1000單細胞微液滴系統(tǒng)

百創(chuàng)S1000亞細胞級分辨率:今年由百創(chuàng)智造推出亞細胞級別空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),不僅打破了國外芯片技術(shù)的壟斷,還突破了分辨率和檢測通量的局限,支持100μm ~5μm多級分辨率分析。成為“亞細胞級分辨率”和“微孔”結(jié)合的原位捕獲空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),全面邁入國產(chǎn)化空間轉(zhuǎn)錄組的亞細胞技術(shù)時代。

百創(chuàng)S1000局部多級分辨率可視化

百創(chuàng)S1000動態(tài)多級分辨率展示

百創(chuàng)S1000-Nanopore空間全長轉(zhuǎn)錄組:今年百創(chuàng)智造發(fā)布了百創(chuàng)S1000-Nanopore空間全長轉(zhuǎn)錄組產(chǎn)品。經(jīng)過不斷研發(fā)測試,百創(chuàng)S1000不僅解決了分辨率低、成本高等難題,其獨立設(shè)計的SpatialBarcode還可以高度適配ONT平臺,獲得的有效數(shù)據(jù)量得到了大幅提高,為廣大科研人員和臨床工作者開展發(fā)育、腫瘤、免疫、神經(jīng)等一系列研究和應(yīng)用提供了新思路。

多種方案,隨心挑選

百邁客植物單細胞核轉(zhuǎn)錄組技術(shù)(snRNA-seq),無需進行原生質(zhì)體的制備,在保證高效捕獲分選單細胞核轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的同時,減少了應(yīng)激基因表達影響、胞質(zhì)內(nèi)代謝物的干擾,并可兼容更大細胞直徑,獲得更全面信息。也為特殊樣本進行單細胞測序提供了新的解決方案,為進一步推動植物單細胞研究提供重要的技術(shù)支撐。

不同植物樣本抽核效果展示

植物單細胞核項目實例數(shù)據(jù)

個性化云交互,自主探索更多可能

百邁客研發(fā)團隊全力打造的單細胞&空間轉(zhuǎn)錄組個性化交互平臺,專為解決廣大客戶的個性化分析問題而生,分析參數(shù)隨心更改、分析不限次數(shù),省時省力,高效完成交互式分析。

單細胞個性化交互云平臺

可自主進行細胞過濾、細胞聚類、maker基因分析、細胞注釋、差異分析等交互式分析。

空間轉(zhuǎn)錄組交互式云平臺

可自主進行spot數(shù)據(jù)過濾、多樣本整合分析、降維聚類分析、基于目標區(qū)域的差異基因分析等步驟。

交互式軟件,便于可視化分析

百邁客自主研發(fā)的多級分辨率可視化工具–Spatial Tools,該工具可以進行自定義展示HE圖、全局聚類圖、目標cluster聚類圖、單細胞聯(lián)合空間細胞類型注釋分布圖。針對感興趣的區(qū)域,可以使用選框或套索工具獲取目標區(qū)域的barcode列表,自定義配色、透明度、標題、圖例調(diào)整等,分析內(nèi)容更加貼近實際所需,交互式功能十分強大。

助力蝴蝶蘭時空圖譜國內(nèi)首秀

影響因子:19.160

發(fā)表單位:復(fù)旦大學(xué)與江西農(nóng)業(yè)大學(xué)

百邁客提供服務(wù):10x Visium空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)

研究內(nèi)容:利用10x Visium空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)分析了蝴蝶蘭花器官早期發(fā)育過程中基因表達的動態(tài)變化。通過對時空表達分布的比較,確定了在特定組織/階段優(yōu)先表達的數(shù)千個基因,包括MADS-box基因和許多其他潛在下游基因,形成了花器官初始化、身份決定和形態(tài)建成的模型。對蘭花開花發(fā)育過程進行了系統(tǒng)的研究,為進一步研究蘭花開花過程中復(fù)雜而重要的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了寶貴的資源。

百邁客項目經(jīng)驗分享

?目前百邁客單細胞轉(zhuǎn)錄組已完成動植物物種50+類,組織類型250+種??臻g轉(zhuǎn)錄組已在100余種不同物種組織類型中得到驗證,突破了軟骨、血管、皮膚、花苞、幼芽等疑難樣本切片透化的難點攻克,積累了豐富的項目經(jīng)驗。

百邁客單細胞(核)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)質(zhì)量穩(wěn)定

百邁客空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)質(zhì)量優(yōu)異

尾聲

凡是過往,皆為序章。直掛云帆,乘風(fēng)破浪。2023我們將砥礪前行,共話新篇章!

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