大多數(shù)二倍體基因組組裝都忽略了同源染色體之間的差異,將基因組組裝成一個假的單倍體序列,這是二倍體類型的組裝的人為共識。這種人為共識可能導(dǎo)致基因注釋的不準(zhǔn)確和生物學(xué)解釋的錯誤。
隨著研究的深入,發(fā)現(xiàn)僅單套的基因組數(shù)據(jù)難以完全演示該物種的全面信息。同源染色體之間不同遺傳位點(diǎn)的組合對生物表型有重要影響,如動植物中的雜種優(yōu)勢、某些物種雜交不育現(xiàn)象等。單倍型等位基因間差異對基因表達(dá)、功能及其表型都有著重要影響,大多數(shù)雜交品種的優(yōu)勢表型都受等位基因調(diào)控。
通過單倍型的分析,可為解析物種重要性狀形成的遺傳機(jī)制奠定重要基礎(chǔ)。單倍型在群體遺傳學(xué)上可分析等位基因間差異,追蹤個體親緣關(guān)系,了解生物遷徙模式和進(jìn)化歷史;在農(nóng)業(yè)上發(fā)掘優(yōu)異等位基因變異,探索雜種優(yōu)勢理論等。
可以對組裝的單倍型基因組的基因特征比較
檢測單倍型基因組間的結(jié)構(gòu)變異
分析單倍型基因組上基因表達(dá)情況,結(jié)合物種組織部位、發(fā)育時期研究等位基因不平衡表達(dá)
分析結(jié)構(gòu)變異所在基因或者附件基因的表達(dá)情況
測序類型 |
完成周期 |
組裝指標(biāo) |
測序深度 |
文庫大小 |
無親本 | 3-6個月(組裝注釋) (視物種具體情況而定) | 單套ContigN50≥2Mb(視物種具體情況而定) | 單套基因組HiFi數(shù)據(jù)≥30x | HiFi:15-20kb |
有親本 | 雙親二代數(shù)據(jù)≥50x 單套基因組HiFi數(shù)據(jù)≥30x | 二代:350bp HiFi:15-20kb |
| 国产一级a毛一级a看免费软件特色 | 亚洲AV无码成人精品区国产 | 免费一级一级人妻a片 | 91精品国产乱码久久久久 | 狼人精品A片一区二区 | 在线观看高清无码 | 久久国产精品一区二区 | 黄色视频网站在线下载 | 一本岛在免费一二三区 | 少妇搡BBBB搡BBB搡打电话 | 美一女一无一伦一精一品在线观看 | 国产无码精品久久豆腐 | 又粗又长又色在线播放 | 波多野结衣20次连续高潮 | 精品人妻一区二区三区浪潮无限 | 无码人妻精品一区二区二秋霞影院 | 91人妻人人搡人人爽 | 人人妻人人爽人人添夜夜 | 搡老女人老妇女aaa一区麻豆 | 无码精品人妻一区二区三 | 91欧美成人精品在线 | 蜜臀AⅤ国产精品久久久国产老师 | 国产与黑人一级A片免费 | 特黄三级又爽又粗又大 | 亚洲色婷婷综合久久久久中文 | 国产拍在线观看不卡 | 国产一级毛片内射年月直播 | 一本一道久久a久久无码 | 山沟女人卖婬在线播放 | 西西大胆色情一区二区三区 | 人妻无码中文字幕免费视频蜜桃 | 一级黄色超级超级片中国 | 国产高潮AA片免费看 | 亚洲+小说+欧美+激情+另类 | 免费一级无码婬片A片 | 国产精品福利姬在线观看 | 93人妻人人揉人人躁人人 | 免费 成人 在线看 国产精品成人免费视频 | 高清无码少妇一区二区 | 91嫖妓按摩店老熟女 |