答:lncRNA的預測包含基本篩選和潛在編碼能力篩選兩部分。
(1)篩選長度≥200bp,Exon個數(shù)≥2,F(xiàn)PKM≥0.1的轉錄本序列進行后續(xù)編碼潛能預測;
(2) 應用主流的CPC分析、CNCI分析、CPAT分析、pfam蛋白結構域分析四種方法對基本篩選獲得的轉錄本進行編碼潛能預測,保留不具編碼潛能的轉錄本序列,四種方法取交集即為最后預測出的LncRNA。
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答:lncRNA的預測包含基本篩選和潛在編碼能力篩選兩部分。
(1)篩選長度≥200bp,Exon個數(shù)≥2,F(xiàn)PKM≥0.1的轉錄本序列進行后續(xù)編碼潛能預測;
(2) 應用主流的CPC分析、CNCI分析、CPAT分析、pfam蛋白結構域分析四種方法對基本篩選獲得的轉錄本進行編碼潛能預測,保留不具編碼潛能的轉錄本序列,四種方法取交集即為最后預測出的LncRNA。
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