Q4. miRNA命名規(guī)則是怎樣的？

答：
參照miRBase的命名規(guī)則：{物種名縮寫(xiě)}-miR-{編號(hào)};miR-前綴后面所跟著的數(shù)字，代表命名的順序，比如，miR-124比miR-456發(fā)現(xiàn)得早?！癿iR-”代表成熟的miRNA、“mir-”代表pre-miRNA和pri-miRNA、“MIR”代表編碼miRNA的基因。
miRNA幾乎全是獨(dú)一的編碼順序，但對(duì)于擁有一兩個(gè)堿基不同的則會(huì)被標(biāo)上字母以示，例如，miR-124a與miR-124b。 若成熟的miRNA相同，但pre-miRNA和pri-miRNA和編碼他們的基因來(lái)自于不同的基因組，則使用數(shù)字來(lái)表示，例如，mir-194-1和mir-194-2表示兩個(gè)pre-， pri-miRNA剪切后的成熟miRNA是完全相同的，但卻是兩個(gè)不同的來(lái)源。
前綴的三個(gè)字母代表了不同的種族來(lái)源，例如，hsa-miR-194代表miRNA來(lái)源于人類(lèi)，oar-miR-124來(lái)源于綿羊。
對(duì)于形成pre-，pri-miRNA莖環(huán)的兩端miRNA， 通常一端在數(shù)量上遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)另一端。數(shù)量?jī)?yōu)勢(shì)的一端往往稱為guide strand，而另一端被稱為passenger strand，通常被大量降解，用*號(hào)來(lái)表示，例如miR-124和miR-124*。
最新版中miRBase已經(jīng)不再使用*來(lái)標(biāo)記microRNA與其發(fā)夾前體互補(bǔ)配對(duì)位置的互補(bǔ)序列，而是使用“-3p”與“-5p”作為區(qū)分這兩條序列的后綴替代舊的的命名法。(參考http://www.mirbase.org/help/nomenclature.shtml)
舉例： aly-miR158b-3p， aly 代表這是Arabidopsis lyrata 物種的miRNA, -miR158b表示這是成熟的miRNA , 其中b表示還有一個(gè)miRNA序列與它相似，僅有一兩個(gè)堿基不同。 -3p 表示它從前體的3’端剪切得到。
對(duì)新預(yù)測(cè)的miRNA 我們統(tǒng)一用 novel_miR_{數(shù)字編號(hào)} 來(lái)命名， 如 novel_miR_4974。